Uroczystości pogrzebowe odbyły się 4 lipca w bazylice Imienia Najświętszej Maryi Panny i świętego Bartłomieja Apostoła w Piekarach Śląskich. To właśnie w tym mieście ks. Franciszek Czernik spędził ostatnie lata swojego życia. Eucharystię koncelebrowało wielu księży z diecezji gliwickiej, katowickiej i opolskiej. – To był kolorowy ptak w naszym ogrodzie diecezjalnym. I tak jak kolorowy ptak ma wiele kolorów, tak on potrafił te kolory dla naszego dobra i naszej radości odkrywać w nas, bo my też nie jesteśmy jednokolorowi – podkreślił w homilii bp senior Gerard Kusz, który przewodniczył Mszy pogrzebowej. Wspominał też zamiłowanie ks. Franciszka Czernika do podróży oraz przypomniał jego działalność na rzecz głuchoniemych.