Pierwszy kościół (lub kaplica) istniał w Szałszy około 1460 roku. Tak datowany jest gotycki obraz tablicowy przedstawiający Matkę Boską z Dzieciątkiem w otoczeniu dwunastu apostołów, który trafił z dawnego kościoła do głównego ołtarza obecnej świątyni. Od 2009 roku obraz znajduje się w Ośrodku Formacyjno-Edukacyjnym Diecezji Gliwickiej w Rudach. Obecny kościół Narodzenia Najświętszej Maryi Panny w Szałszy przez długi czas datowany był na XVII w. Przeprowadzone w 2009 roku badania dendrochronologiczne przesunęły datę budowy o cały wiek wstecz. Najstarsze zachowane drewniane elementy konstrukcji pochodzą z lat 1553 i 1554, są one jednak nieliczne.